El campus universitario “Sede Morona», se encuentra en la ciudad de Macas, cantón Morona, en las calles: Av. Capitán José Villanueva y María Troncati.

En este campus se encuentra ubicada la Unidad Académica de Ciencias Sociales, Periodismo, Información y Derecho, la Unidad Académica de Administración y la Unidad Académica de Educación

El campus cuenta con un bloque de estudios, con áreas para docentes, laboratorios informáticos, biblioteca, áreas de recreación y departamentos administrativos. Además, se encuentran las carreras de: Ciencias de la Educación Mención Educación Inicial y Parvularia, Educación Inicial, Contabilidad y Auditoría, Economía, Empresas, Ingeniería Empresarial, Ingeniería en Contabilidad y Auditoría.